Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSRNP1Q96S65 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSRNP1Q96S65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSRNP1Q96S65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms