Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NODALQ96S42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NODALQ96S42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NODALQ96S42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NODALQ96S42 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms