Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP5Q96RT8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP5Q96RT8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms