Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FERD3LQ96RJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FERD3LQ96RJ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FERD3LQ96RJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FERD3LQ96RJ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FERD3LQ96RJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms