Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PANX1Q96RD7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PANX1Q96RD7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms