Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HHIPQ96QV1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HHIPQ96QV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms