Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IPQ96QF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IPQ96QF0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms