Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPALINQ96PE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OPALINQ96PE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPALINQ96PE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms