Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXN4Q96NZ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXN4Q96NZ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXN4Q96NZ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms