Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LRRC7Q96NW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LRRC7Q96NW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LRRC7Q96NW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LRRC7Q96NW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms