Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM20AQ96MK3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM20AQ96MK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM20AQ96MK3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms