Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JSRP1Q96MG2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JSRP1Q96MG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JSRP1Q96MG2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms