Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00615Q96LM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00615Q96LM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms