Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCORQ96JN0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCORQ96JN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCORQ96JN0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms