Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF2Q96GP6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARF2Q96GP6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF2Q96GP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms