Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP36Q96G28 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP36Q96G28 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP36Q96G28 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP36Q96G28 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms