Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERPQ96FX8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERPQ96FX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERPQ96FX8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PERPQ96FX8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PERPQ96FX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PERPQ96FX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms