Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC4Q96FT7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ASIC4Q96FT7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASIC4Q96FT7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms