Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TVP23CQ96ET8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms