Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF31Q96EP0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF31Q96EP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF31Q96EP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms