Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEURL3Q96EH8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEURL3Q96EH8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms