Protein–RNA interactions for Protein: Q96DR5

BPIFA2, BPI fold-containing family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA2Q96DR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BPIFA2Q96DR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA2Q96DR5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA2Q96DR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms