Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXPE2Q96DL1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXPE2Q96DL1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms