Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCCAG3Q96C92 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3Q96C92 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3Q96C92 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms