Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARVELD3Q96A59 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms