Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SNX21Q969T3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNX21Q969T3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms