Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2A3Q93084 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A3Q93084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A3Q93084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms