Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4DQ92854 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4DQ92854 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4DQ92854 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA4DQ92854 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4DQ92854 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4DQ92854 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4DQ92854 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms