Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DPF3Q92784 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DPF3Q92784 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DPF3Q92784 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DPF3Q92784 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms