Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERVK_113Q902F9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERVK_113Q902F9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms