Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATRIPQ8WXE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATRIPQ8WXE1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATRIPQ8WXE1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms