Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CASKIN1Q8WXD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CASKIN1Q8WXD9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CASKIN1Q8WXD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CASKIN1Q8WXD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CASKIN1Q8WXD9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms