Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG3Q8WXD2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG3Q8WXD2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms