Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCTD4Q8WVF5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCTD4Q8WVF5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCTD4Q8WVF5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms