Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC12Q8WUD4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC12Q8WUD4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms