Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRP4Q8TDF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRP4Q8TDF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RASGRP4Q8TDF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms