Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRSK1Q8TDC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRSK1Q8TDC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms