Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46DQ8NEK8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46DQ8NEK8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms