Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC197Q8NCU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms