Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HJURPQ8NCD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HJURPQ8NCD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms