Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACBD4Q8NC06 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms