Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATAD1Q8NBU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATAD1Q8NBU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD1Q8NBU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATAD1Q8NBU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms