Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ7

SUMF2, Sulfatase-modifying factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2Q8NBJ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUMF2Q8NBJ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SUMF2Q8NBJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms