Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC63Q8NA47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC63Q8NA47 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC63Q8NA47 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC63Q8NA47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms