Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM71DQ8N9W8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71DQ8N9W8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71DQ8N9W8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms