Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYT2Q8N9I0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT2Q8N9I0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT2Q8N9I0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT2Q8N9I0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms