Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUD6BQ8N6M0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD6BQ8N6M0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD6BQ8N6M0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms