Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC155Q8N6L0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC155Q8N6L0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms