Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PQLC1Q8N2U9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PQLC1Q8N2U9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms