Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EID3Q8N140 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EID3Q8N140 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms